Les Philippines sont un vaste archipel qui se compose de plus de 7000 îles réparties sur une superficie de 298 000 kilomètres carrés. Le pays tout entier peut être divisé en trois zones principales de plongées, les Visayas et Cebu dans la partie orientale du pays, le parc national de Tubbataha Reefs dans la mer de Sulu et Coron/Apo Reef situés dans les îles Busuanga. Ces destinations sont constituées de différents écosystèmes recensant une grande variété d'espèces marines. Les Philippines sont une des régions les plus riches en biodiversité dans le monde. Les croisières plongées aux Philippines sont de loin la meilleure façon de découvrir chacune des différentes zones.
Les Visayas se composent de nombreux récifs aux pentes douces et des mini-tombants couverts de coraux mous et durs. Sur les secs autour de Moalboal et des îles Pescador, il y'a la possibilité de rencontrer le requin baleine car il y a une forte concentration à Tan Awan (Oslob) à la pointe sud-est de L'île de Cebu. Au nord de l'île de Malapascua, les plongées à l'aube pourront vous permettre d'observer les requins renards sur le site de Moad shoal qui est une référence mondiale pour voir ce type de requins.
Tubbataha Reefs est pour l'ensemble des plongeurs Philippins, la meilleur zone de plongées des Philippines car son accès en pleine mer est restreint et seul les mois de Mars à Juin permettent de s'y rendre sans danger. Ses parois verticales sont remplies de coraux et attirent les pélagiques comme les raies mantas et une bonne variété de requins.
Coron est surtout connu pour les nombreuses épaves japonaises de la Seconde Guerre mondiale autour de l'île de Busuanga, celles-ci ont été coulé lors de la bataille de Coron Bay. Beaucoup de ces épaves sont dans les limites de la plongée loisirs et accessible à partir du niveau 2.
Le parc naturel de Apo Reef (à ne pas confondre avec Apo Island dans le sud des Visayas) est une vaste zone de 34 kilomètres carrés avec d'innombrables récifs et sites de plongées. Ici vous pourrez plonger sur des tombants riches en coraux mous et le long des pentes douces avec toujours de grands bancs de poissons, requins et autres espèces pélagiques comme les raies Manta et les raies aigle.
Il y a également une zone mondialement connue pour sa plongée de type "macro" dans les environs de Anilao, où les plongeurs peuvent voir de nombreuses espèces uniques de Nudibranches et d'autres animaux rares.